Aux XII^e et XIII^e siècles, la communauté de Boudou faisait partie des possessions de l’abbaye de Moissac.
Bertrand de Montaigut (1260 – 1293) puissant abbé y vécut avec sa famille jusqu’à sa mort. Il a présidé le parlement du Languedoc et a été conseiller des rois de France, a étendu l’influence et les possessions de l’abbaye.
De cette lointaine époque troublée il ne reste que peu de vestiges : une baie dans l’église du village ; un curieux puits à voûtes qui était peut-être inclus dans le mur d’enceinte de simple police qui entourait et protégeait sa demeure (voir cadastre XVII^e dont une copie est consultable en mairie)